More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2168 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  99.24 
 
 
262 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.9 
 
 
261 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.73 
 
 
263 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.87 
 
 
251 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1339  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  71.43 
 
 
261 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.789963  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.17 
 
 
261 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0372396  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.26 
 
 
236 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  42 
 
 
257 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
267 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
258 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
256 aa  188  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
255 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
267 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
223 aa  176  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
255 aa  158  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.836425  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 
275 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0247795  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.47 
 
 
257 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25395  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0928322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
271 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.649512  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
282 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
242 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
261 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 
277 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
249 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
265 aa  111  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 
265 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 
254 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  31.74 
 
 
256 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
260 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
238 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
259 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
245 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.980517  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
266 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
239 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
245 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  32.05 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
266 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
244 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.61 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
276 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0836216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  31.15 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  28.19 
 
 
239 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 
254 aa  92.8  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
295 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
249 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
249 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.45 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802669  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
238 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.52 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3685  short chain dehydrogenase  31.06 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.26 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 
249 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
239 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.59 
 
 
242 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  36.1 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>