More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0271 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.8 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  68.24 
 
 		 255 aa  298  4e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  56.15 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.43 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.8 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.46 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.95 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  46.22 
 
 		 249 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  31.69 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  29.39 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  40.49 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.53 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  29.22 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.93 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.53 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  29.66 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.2 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.67 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15900  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.78 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.166031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.14 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.82 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  27.5 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.372057  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.44 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.38 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2091  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  27.09 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.01 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>