More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  100 
 
 
247 aa  484  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.12 
 
 
246 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.42 
 
 
260 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.42 
 
 
260 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.42 
 
 
260 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 
249 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.35 
 
 
252 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  65.02 
 
 
249 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.26 
 
 
247 aa  281  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.79 
 
 
247 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.08 
 
 
256 aa  268  8.999999999999999e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.25 
 
 
249 aa  258  6e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
251 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  53.25 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.15 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
257 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 
256 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 
256 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 
256 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 
260 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
254 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  40 
 
 
246 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
246 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
253 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  39.59 
 
 
246 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
254 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
243 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
244 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
246 aa  141  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 
243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
245 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 
247 aa  134  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
248 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 
245 aa  131  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
249 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
248 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
243 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
254 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  28.46 
 
 
240 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
244 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
247 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.39 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  27.53 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  26.44 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  30.19 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  23.98 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.433437  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2277  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.98 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000536338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.35 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.8 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  28.65 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  29.19 
 
 
242 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  28.31 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  28.65 
 
 
242 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.57 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  28.65 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  28.32 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.28 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  25.79 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  25 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.72 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.5 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.18 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1610  acetoacetyl-CoA reductase  27.67 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  29 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.42 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  27.89 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  27.62 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.39 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  24.63 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>