More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4120 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  507  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  64.84 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  64.84 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  64.84 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  62.6 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.39 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  60.62 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  60.23 
 
 		 260 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  61.81 
 
 		 251 aa  301  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  46.56 
 
 		 255 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.55 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  33.2 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  30.36 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  30.95 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.35 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  27.35 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  28.97 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  28.23 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.86 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  27.6 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.29 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  26.96 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.72 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.46 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  28.04 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.02 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  30 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  29.56 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0604  hypothetical protein  27.51 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.06 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02393  short chain oxidoreductase/dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01770)  31.28 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.559669 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  27.72 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  30.41 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.31 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  30.05 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  27.45 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  30.05 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.06 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>