More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1950 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  47.52 
 
 		 245 aa  208  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  46.12 
 
 		 243 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  46.28 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 243 aa  195  6e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  44.72 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  45.38 
 
 		 245 aa  175  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  45.34 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  43.5 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  45.16 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  35.83 
 
 		 240 aa  138  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 245 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  33.61 
 
 		 249 aa  111  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.75 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  32.51 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.69 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.45 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.05 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  25.51 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  25.3 
 
 		 250 aa  85.5  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  24.1 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06941  short-chain dehydrogenase/reductase  27.27 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.492424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0072  short-chain dehydrogenase/reductase  27.27 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  21.95 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  21.95 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2872  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000709968  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  24.8 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  29.08 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  24.8 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.88 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  24.8 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  23.67 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.04 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.26 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  24.5 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2748  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.68 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3264  putative oxidoreductase protein  30.65 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  29.59 
 
 		 592 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.5 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>