More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13825 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  100 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  85.94 
 
 
256 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  85.94 
 
 
256 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  85.94 
 
 
256 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  77.69 
 
 
260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  76.92 
 
 
260 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.75 
 
 
253 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 
254 aa  331  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  63.64 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
251 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
255 aa  201  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
249 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
252 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
250 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  43.32 
 
 
247 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
249 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
247 aa  162  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
246 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
260 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
260 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
260 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
256 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
247 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  41.56 
 
 
249 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
245 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
247 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
247 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
270 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
250 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
246 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
246 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
249 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.09 
 
 
249 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 
246 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 
243 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
246 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 
244 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
248 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
245 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
241 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  29.27 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  28.93 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  28.72 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  29.38 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  26.94 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  26.4 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  28.57 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.87 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  26.24 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  26.15 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  27.66 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  27.66 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  27.66 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  27.13 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  27.66 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  27.66 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  27.13 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.42 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  27.78 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  27.78 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.64 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  26.64 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2479  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.23 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200677  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1633  acetyacetyl-CoA reductase  25.89 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.389319 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0621  hypothetical protein  25.78 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.27 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  26.5 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  26.88 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90732  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0557  acetoacetyl-CoA reductase  27.55 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.306822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>