More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4050 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 243 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  53.91 
 
 		 243 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  49.38 
 
 		 243 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  49.58 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 		 245 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  47.33 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  43.39 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 248 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.33 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.66 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  33.74 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  32.54 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 249 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  27.5 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  27.08 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  26.29 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  26.83 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.81 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  27.35 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.7 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  30.29 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.8 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  22.95 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.93 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  25.91 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  25.21 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  29.26 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  26.03 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.86 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  22.86 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0142  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.29 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>