More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12109 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  100 
 
 
249 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.49 
 
 
249 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.54 
 
 
260 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.54 
 
 
260 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.54 
 
 
260 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.7 
 
 
252 aa  325  5e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.69 
 
 
247 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  64.2 
 
 
247 aa  297  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.56 
 
 
246 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 
247 aa  272  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
256 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
249 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 
251 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
250 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  49.39 
 
 
255 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
256 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
256 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  42.45 
 
 
256 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  41.74 
 
 
251 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
244 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
257 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
260 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  39.17 
 
 
246 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
243 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
248 aa  141  8e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
253 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
245 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  37.92 
 
 
246 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  33.74 
 
 
243 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 
246 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
246 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 
270 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  35.39 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 
248 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  35.95 
 
 
243 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
245 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
255 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  35.16 
 
 
249 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
247 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  25.91 
 
 
240 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
250 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 
261 aa  92.4  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  29.66 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.32 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.76 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38500  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  30.71 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  29.13 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  28.96 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  29.51 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  25.61 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  28.51 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
277 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  28.96 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  34.76 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  28.96 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  28.96 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  26.72 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>