More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5791 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  100 
 
 
249 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  66.26 
 
 
245 aa  316  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  62.35 
 
 
248 aa  292  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  61.48 
 
 
247 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  59.02 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  51.65 
 
 
244 aa  241  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  46.09 
 
 
243 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  41.98 
 
 
243 aa  208  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 
245 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
243 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 
246 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 
246 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
246 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
246 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 
245 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
248 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
245 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
247 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  42.42 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
251 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
254 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  35.77 
 
 
247 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
245 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
249 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.96 
 
 
251 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
246 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
256 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
241 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
254 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
247 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  39.76 
 
 
249 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 
260 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 
254 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  35 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
238 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  37.35 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
270 aa  85.1  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.18 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  31.1 
 
 
261 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.96 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  32.39 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
254 aa  79  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  31.91 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0557  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000797066  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.99 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64840  putative short-chain dehydrogenase  32.81 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000142595  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62919  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  32.86 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  24.87 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.95 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  25.71 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  32.81 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.87 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155421  hitchhiker  0.00000000000159857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>