More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0885 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 250 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  73.68 
 
 		 249 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  68.95 
 
 		 249 aa  361  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  59.59 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  56.4 
 
 		 251 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  53.6 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  53.06 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  51.22 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  51.63 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  49.39 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01994  short chain dehydrogenase  73.85 
 
 		 130 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000979327  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  35.29 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  34.9 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  28.86 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.64 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  32.99 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.767704 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.26 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  32.47 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.51 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 278 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0353  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.42 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.45647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0344  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.57 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 238 aa  95.1  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  31.44 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  29.03 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0363598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 291 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 281 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 		 344 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>