More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0469 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  66.09 
 
 		 291 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0117  short chain dehydrogenase  58.47 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  55.82 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  53.06 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0632  short chain dehydrogenase  53.44 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2452  short chain dehydrogenase  53.33 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13470  short chain dehydrogenase  50.4 
 
 		 251 aa  265  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10962  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 		 245 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4881  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.968651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4715  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 249 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4421  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1853  short chain dehydrogenase  44.96 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.787999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4335  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0693718  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.8 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01994  short chain dehydrogenase  62.31 
 
 		 130 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000979327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 242 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0185  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 256 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0352  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 259 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0407  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0087  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3096  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0589  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2288  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2000  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0427  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0449  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.237578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0099  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6265  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2834  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.499263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2937  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2308  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2922  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2971  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0130  short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.727225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 249 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  32.46 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.92 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 243 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 258 aa  95.5  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 344 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136725 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0382  short chain dehydrogenase  33.06 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  29.72 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0185  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  31.77 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.01 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.77 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.75 
 
 		 239 aa  92.8  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 		 258 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2296  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 		 238 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0366896 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  31.41 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  33.84 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  32.46 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.68 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  29.96 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  31.09 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 252 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 237 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 239 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>