More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01815 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003864  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  81.33 
 
 
241 aa  417  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.013707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0637  short chain dehydrogenase  59.49 
 
 
241 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.27 
 
 
238 aa  237  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
240 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  48.5 
 
 
239 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.8 
 
 
239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.52 
 
 
239 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
238 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.26 
 
 
239 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
240 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
238 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
266 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 
275 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
266 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
266 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
266 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
266 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.857449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0813  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.06 
 
 
253 aa  187  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
266 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.21 
 
 
266 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
249 aa  178  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.18 
 
 
251 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
260 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2469  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 
265 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
250 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 
245 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
250 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.59 
 
 
250 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
264 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
251 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
262 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0729  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
259 aa  132  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
260 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
260 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
277 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1119  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.47 
 
 
262 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
260 aa  121  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
242 aa  121  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
260 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0085  gluconate 5-dehydrogenase  36.45 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
257 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
258 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.461582  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
256 aa  115  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
282 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390824  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
254 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1087  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  32.63 
 
 
245 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
263 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
245 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0379321  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6102  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
264 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0605001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
245 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19024  normal  0.201158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
260 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
300 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0496  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
251 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
267 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0230  hypothetical protein  31.58 
 
 
261 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.599536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
270 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3863  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
260 aa  99  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331172  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
266 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  32 
 
 
261 aa  95.1  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.841301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  30.64 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0427  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
249 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.980517  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.88 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  27.71 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
249 aa  89  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2676  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
264 aa  89  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
261 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 
260 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
263 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0470  short chain dehydrogenase  27.71 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.444612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>