More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0904 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
553 aa  1098    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  78.66 
 
 
553 aa  842    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.19 
 
 
559 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  55.23 
 
 
554 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.53 
 
 
555 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.96 
 
 
568 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.42 
 
 
568 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.42 
 
 
568 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  53.24 
 
 
568 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  53.42 
 
 
568 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.24 
 
 
568 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  53.42 
 
 
568 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  53.42 
 
 
568 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.53 
 
 
566 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  53.44 
 
 
568 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.71 
 
 
563 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.9 
 
 
557 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.44 
 
 
568 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.62 
 
 
568 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.8 
 
 
568 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  53.8 
 
 
568 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.01 
 
 
555 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.08 
 
 
568 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.62 
 
 
568 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.63 
 
 
561 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.54 
 
 
557 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.71 
 
 
566 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  54.07 
 
 
566 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.28 
 
 
575 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  50.81 
 
 
554 aa  486  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.72 
 
 
552 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.92 
 
 
552 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.67 
 
 
582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.08 
 
 
556 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.85 
 
 
496 aa  84  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  29.17 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.8 
 
 
991 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3847  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.26 
 
 
488 aa  77  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.794962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
487 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.01 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.09 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
996 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 
503 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  29.61 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  30.92 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.33 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  29.61 
 
 
489 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.51 
 
 
991 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  30.59 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  27.14 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  28 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05275  aldehyde dehydrogenase  25.56 
 
 
836 aa  73.6  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  26.58 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  31.1 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  29.28 
 
 
489 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  24.78 
 
 
477 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.59 
 
 
487 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.11 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.52 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.57 
 
 
975 aa  70.5  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.05 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  27.17 
 
 
488 aa  70.1  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  25.18 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.63 
 
 
991 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0748  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  26.73 
 
 
675 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1456  putative betaine aldehyde dehydrogenase (BADH) oxidoreductase protein  25.45 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  29.46 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.1 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5157  aldehyde dehydrogenase  25.07 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204218  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  25.93 
 
 
535 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4666  aldehyde dehydrogenase  24.86 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4578  aldehyde dehydrogenase  24.86 
 
 
489 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1600  aldehyde dehydrogenase  25.27 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3827  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 
678 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.145671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3884  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.6 
 
 
1175 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.42 
 
 
993 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.61 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1641  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.86 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  27.42 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  27.5 
 
 
531 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.61 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1548  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.59 
 
 
516 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4961  aldehyde dehydrogenase  25.49 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7300  Aldehyde Dehydrogenase  28.93 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.784952  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.66 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1763  aldehyde dehydrogenase  26.3 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688744  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0217  aldehyde dehydrogenase  25.98 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.66 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1828  aldehyde dehydrogenase  26.3 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1781  aldehyde dehydrogenase  26.3 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  25.47 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  25.73 
 
 
1111 aa  67.4  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.989861  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  26.99 
 
 
467 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  26.62 
 
 
513 aa  67  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  28.33 
 
 
478 aa  67  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1625  aldehyde dehydrogenase  27.01 
 
 
518 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0898756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>