More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1136 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
552 aa  1149    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  45.19 
 
 
554 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.92 
 
 
553 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.89 
 
 
568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.43 
 
 
557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.07 
 
 
568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.99 
 
 
555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  44.71 
 
 
568 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  44.71 
 
 
568 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.71 
 
 
568 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.71 
 
 
568 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  44.53 
 
 
568 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  44.71 
 
 
568 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.35 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.96 
 
 
553 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  41.42 
 
 
575 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.87 
 
 
563 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.55 
 
 
568 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.4 
 
 
582 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  43.8 
 
 
568 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.59 
 
 
568 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.16 
 
 
568 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.16 
 
 
568 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  44.55 
 
 
568 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.55 
 
 
568 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.49 
 
 
566 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  41.79 
 
 
561 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.57 
 
 
559 aa  413  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  41.61 
 
 
557 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  44.87 
 
 
566 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  41.68 
 
 
552 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.87 
 
 
566 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  42.08 
 
 
554 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  38.46 
 
 
556 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1641  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.93 
 
 
525 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  24.14 
 
 
500 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3333  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.24 
 
 
521 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000027969 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  26.04 
 
 
996 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0014  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.31 
 
 
522 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.440333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.6 
 
 
993 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  23.11 
 
 
496 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  28.9 
 
 
473 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  24.38 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.52 
 
 
991 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25 
 
 
1001 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.52 
 
 
991 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.05 
 
 
991 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.88 
 
 
993 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07430  hypothetical protein  24.37 
 
 
481 aa  97.8  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.782737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2555  betaine aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
490 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0789453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0338  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4965  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0355  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0289  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.98 
 
 
515 aa  96.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0074  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.53 
 
 
530 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0279  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0282  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0381  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  24.73 
 
 
493 aa  96.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0309  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0340  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0295  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.53 
 
 
515 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  24.48 
 
 
496 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  22.57 
 
 
498 aa  93.6  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0274  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.41 
 
 
515 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  23.08 
 
 
498 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  24.57 
 
 
496 aa  91.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  24.28 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2005  aldehyde dehydrogenase  24.74 
 
 
516 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 
490 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0290  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.06 
 
 
515 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  23.82 
 
 
476 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1731  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.85 
 
 
514 aa  90.1  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  24.94 
 
 
503 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1043  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.3 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5114  betaine aldehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
490 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.502365  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  24.29 
 
 
486 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2734  aldehyde dehydrogenase  27.81 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.03 
 
 
1003 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  23.56 
 
 
498 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22 
 
 
1006 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  26.53 
 
 
495 aa  88.2  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  24.48 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  27.3 
 
 
492 aa  87.8  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2950  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  28.85 
 
 
493 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.241533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  25.6 
 
 
486 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  25.6 
 
 
486 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1548  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.46 
 
 
516 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  25.6 
 
 
486 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  23.65 
 
 
497 aa  87  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  26.99 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  25.07 
 
 
486 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00268  betaine aldehyde dehydrogenase, NAD-dependent  25.9 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3294  betaine aldehyde dehydrogenase  25.9 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  25.33 
 
 
486 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  22.86 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  25.07 
 
 
486 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.73 
 
 
990 aa  86.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2922  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.53 
 
 
521 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>