More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0370 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.42 
 
 
552 aa  672    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  100 
 
 
554 aa  1148    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  83.06 
 
 
555 aa  965    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  55.83 
 
 
554 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  56.19 
 
 
568 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  56.19 
 
 
568 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  56.19 
 
 
568 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.66 
 
 
568 aa  589  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.83 
 
 
568 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  56.01 
 
 
568 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.83 
 
 
568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.66 
 
 
568 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.94 
 
 
568 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.32 
 
 
575 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  54.22 
 
 
568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.94 
 
 
568 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  54.94 
 
 
568 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.94 
 
 
568 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.58 
 
 
568 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.76 
 
 
568 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.3 
 
 
563 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.44 
 
 
557 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.35 
 
 
566 aa  560  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.48 
 
 
566 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  53.58 
 
 
566 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.55 
 
 
555 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.98 
 
 
561 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.44 
 
 
557 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.56 
 
 
556 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.35 
 
 
553 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  50.63 
 
 
553 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.43 
 
 
559 aa  462  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.62 
 
 
582 aa  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.08 
 
 
552 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  26.03 
 
 
482 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  27.51 
 
 
478 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  25.08 
 
 
502 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  24.37 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  24.27 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
996 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90594  Meiotic Sister-Chromatid recombination aldehyde dehydrogenase  23.66 
 
 
616 aa  73.6  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.308604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.1 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  28.52 
 
 
479 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  27.12 
 
 
478 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  27.09 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.67 
 
 
487 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.71 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.26 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03681  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  23.83 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.975414  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0128  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  26.09 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3373  Aldehyde Dehydrogenase  27.72 
 
 
532 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  26.64 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  27.96 
 
 
526 aa  70.1  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3333  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.93 
 
 
521 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000027969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  25.55 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.17 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1970  aldehyde dehydrogenase  25.71 
 
 
494 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0798984  normal  0.254214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.99 
 
 
487 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  27.27 
 
 
536 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.11 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.11 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.24 
 
 
486 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.2 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  26.23 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.7 
 
 
1006 aa  67.4  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  25.55 
 
 
493 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1000  aldehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
494 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  24.14 
 
 
472 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05644  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13500)  24.52 
 
 
505 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3562  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.56 
 
 
488 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0233  aldehyde dehydrogenase  28.92 
 
 
490 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.49 
 
 
487 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05194  putative benzaldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  26.78 
 
 
492 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0026447  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  25.42 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5719  aldehyde dehydrogenase  26.78 
 
 
511 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  22.96 
 
 
506 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000365  betaine aldehyde dehydrogenase  25.36 
 
 
486 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.44 
 
 
487 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0880  aldehyde dehydrogenase  27.91 
 
 
510 aa  65.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1244  Aldehyde Dehydrogenase  25.77 
 
 
490 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00471898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.36 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4113  Aldehyde Dehydrogenase  25.16 
 
 
512 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189618  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.36 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.2 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.11 
 
 
487 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  23.1 
 
 
516 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.02 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 
486 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2801  aldehyde dehydrogenase  25.66 
 
 
489 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000306882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1086  aldehyde dehydrogenase  26.61 
 
 
490 aa  65.1  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0121968  decreased coverage  0.00153229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  27.15 
 
 
486 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  23.52 
 
 
513 aa  64.3  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  26.8 
 
 
486 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0787  aldehyde dehydrogenase  28.77 
 
 
511 aa  64.3  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0382  aldehyde dehydrogenase  25 
 
 
491 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.515832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.62 
 
 
477 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  24.81 
 
 
463 aa  63.9  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>