More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01930 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
582 aa  1188    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.02 
 
 
557 aa  627  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  52.52 
 
 
554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.81 
 
 
557 aa  568  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.74 
 
 
561 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.52 
 
 
575 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.83 
 
 
568 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.65 
 
 
568 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  53.83 
 
 
568 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.01 
 
 
568 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  53.12 
 
 
568 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.42 
 
 
555 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.56 
 
 
563 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.39 
 
 
568 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  53.21 
 
 
568 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  53.21 
 
 
568 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.21 
 
 
568 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.83 
 
 
568 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.39 
 
 
568 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.86 
 
 
568 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  53.21 
 
 
568 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.83 
 
 
568 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  53.04 
 
 
568 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.67 
 
 
566 aa  545  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.9 
 
 
566 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  54.19 
 
 
566 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.87 
 
 
555 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.14 
 
 
556 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.4 
 
 
552 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.62 
 
 
552 aa  458  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  45.62 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.41 
 
 
553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.49 
 
 
553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  46.52 
 
 
559 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  26.97 
 
 
496 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  24.88 
 
 
471 aa  91.7  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3957  aldehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
489 aa  90.9  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  27.29 
 
 
482 aa  91.3  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2504  aldehyde dehydrogenase  25.53 
 
 
523 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0589644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  26.65 
 
 
481 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
487 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.34 
 
 
993 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0352  aldehyde dehydrogenase  25.35 
 
 
499 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  26.39 
 
 
510 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0457  aldehyde dehydrogenase  27.68 
 
 
489 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2922  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.6 
 
 
521 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.76 
 
 
993 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2625  Aldehyde Dehydrogenase  28.89 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3191  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.43 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000779709  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.82 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.82 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  22.98 
 
 
480 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  25.06 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2918  Aldehyde Dehydrogenase  25.12 
 
 
497 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  29.51 
 
 
502 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2352  aldehyde dehydrogenase  27.03 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.52 
 
 
486 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  27.95 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  26.6 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  26.6 
 
 
489 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.06 
 
 
991 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3333  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.21 
 
 
521 aa  77  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000027969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  26.12 
 
 
496 aa  77  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.21 
 
 
476 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  25.28 
 
 
479 aa  77  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  26.21 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.06 
 
 
486 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  26.06 
 
 
457 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3895  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.16 
 
 
480 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0657  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.78 
 
 
486 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00563166  hitchhiker  0.00000657572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0619  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  23.79 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3670  aldehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  25.28 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  30.25 
 
 
483 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  25.78 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1756  aldehyde dehydrogenase  24.83 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  31.75 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4738  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5033  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4650  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.84 
 
 
991 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.36 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.29 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.1 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1641  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.75 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  24.62 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0302  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  25.68 
 
 
490 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1074  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.17 
 
 
492 aa  73.9  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.178667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  26.07 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10767  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase mmsA  24.59 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0017569  normal  0.759995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0338  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.93 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0290  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.63 
 
 
515 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.14 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0282  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.93 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0309  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.93 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>