More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0470 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  85.87 
 
 
568 aa  971    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.55 
 
 
557 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  83.92 
 
 
568 aa  939    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  68.53 
 
 
554 aa  789    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  84.28 
 
 
568 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  85.34 
 
 
568 aa  956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  83.92 
 
 
568 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  84.81 
 
 
568 aa  963    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  84.28 
 
 
568 aa  943    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  61.01 
 
 
561 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  84.28 
 
 
568 aa  956    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  100 
 
 
566 aa  1154    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  84.45 
 
 
568 aa  946    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  84.81 
 
 
568 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  86.04 
 
 
568 aa  964    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  83.92 
 
 
568 aa  939    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  86.15 
 
 
568 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  87.57 
 
 
563 aa  992    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  95.23 
 
 
566 aa  1039    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  86.04 
 
 
568 aa  964    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  83.75 
 
 
568 aa  937    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.61 
 
 
575 aa  630  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.27 
 
 
555 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.32 
 
 
557 aa  618  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.56 
 
 
555 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.69 
 
 
566 aa  581  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.09 
 
 
552 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  53.58 
 
 
554 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.64 
 
 
559 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  54.19 
 
 
582 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.71 
 
 
553 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.71 
 
 
553 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.19 
 
 
556 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  44.65 
 
 
552 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.75 
 
 
993 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  26.43 
 
 
996 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3333  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.46 
 
 
521 aa  84  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000027969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1641  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.26 
 
 
525 aa  83.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4023  Aldehyde Dehydrogenase  28.67 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1043  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.72 
 
 
515 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0811  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.11 
 
 
486 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0274  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.72 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0647  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.41 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0597241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3847  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.45 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.794962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
486 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3490  Aldehyde Dehydrogenase  27.91 
 
 
488 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836011  normal  0.347598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
486 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  26.91 
 
 
510 aa  79.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  26.75 
 
 
513 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1548  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.78 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6305  aldehyde dehydrogenase  31.48 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.482135  normal  0.128394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3846  aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5579  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  31.48 
 
 
492 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623419  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6518  benzaldehyde dehydrogenase (NAD(+))  30.82 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1311  benzaldehyde dehydrogenase (NAD+)  30.82 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4733  aldehyde dehydrogenase  29.58 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3126  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.18 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187882  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0580  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  29.55 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0613  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.45 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6120  aldehyde dehydrogenase  31.8 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3514  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.26 
 
 
486 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0364  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.54 
 
 
1035 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.929522  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0319  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.54 
 
 
1035 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0134136  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13873  predicted protein  25.85 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  29.86 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  30.77 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0165  Aldehyde Dehydrogenase  23.02 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0486514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  26.99 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3695  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.92 
 
 
486 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  25.52 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  28.2 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  27.52 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3752  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.87 
 
 
486 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  26.52 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3009  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.69 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1503  aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3417  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.2 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.100597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.81 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2610  aldehyde dehydrogenase  22.65 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.514086  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0014  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.13 
 
 
522 aa  73.9  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.440333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5389  aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  28.2 
 
 
472 aa  73.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.26 
 
 
993 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1600  aldehyde dehydrogenase  24.93 
 
 
489 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  30.66 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0656  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.37 
 
 
1236 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.06 
 
 
496 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
457 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1325  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.99 
 
 
1204 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2296  aldehyde dehydrogenase  21.67 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.69034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4666  aldehyde dehydrogenase  24.93 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260999  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  29.02 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4869  aldehyde dehydrogenase  27.63 
 
 
483 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0491848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5157  aldehyde dehydrogenase  25.07 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204218  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2840  aldehyde dehydrogenase  28.08 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.814086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0612  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.18 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.17767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.52 
 
 
1001 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  29.47 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  28.76 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>