More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2840 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2840  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
488 aa  962    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.814086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1907  aldehyde dehydrogenase  48.86 
 
 
485 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.226218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3281  aldehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
499 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7185  aldehyde dehydrogenase  48.43 
 
 
488 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  45.17 
 
 
483 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0871  aldehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
494 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  44.92 
 
 
483 aa  363  4e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  43.75 
 
 
483 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2260  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.98 
 
 
484 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.79 
 
 
498 aa  346  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.26 
 
 
508 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  41.54 
 
 
492 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2603  aldehyde dehydrogenase  46.98 
 
 
532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  42.5 
 
 
490 aa  336  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
492 aa  335  9e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.75 
 
 
490 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  41.72 
 
 
490 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1733  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  40.5 
 
 
501 aa  331  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0102  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.371818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1138  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.75141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1511  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0625314  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  43.81 
 
 
497 aa  327  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2265  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1025  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230435  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  40.17 
 
 
506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0940  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
487 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.59 
 
 
497 aa  325  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02060  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  42.51 
 
 
495 aa  323  5e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6789  Aldehyde Dehydrogenase  44.5 
 
 
495 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2802  aldehyde dehydrogenase  46.5 
 
 
502 aa  323  6e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163668  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  40.56 
 
 
473 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
494 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.36 
 
 
494 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  45.28 
 
 
421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  41.36 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  43.28 
 
 
524 aa  320  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  38.84 
 
 
499 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  40.4 
 
 
494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.81 
 
 
496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152099  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  40.77 
 
 
494 aa  320  5e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.77 
 
 
494 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
494 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
494 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
494 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.84 
 
 
494 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
494 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 
496 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.62 
 
 
494 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6857  aldehyde dehydrogenase  42.17 
 
 
502 aa  319  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0656347  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.55 
 
 
494 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  40.55 
 
 
494 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  40.62 
 
 
494 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  41.77 
 
 
511 aa  318  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  40.62 
 
 
494 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.17 
 
 
494 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.13 
 
 
496 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  40.4 
 
 
494 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  42.09 
 
 
493 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7156  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.87 
 
 
494 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.08 
 
 
496 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.82 
 
 
493 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  40.32 
 
 
494 aa  316  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 
487 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  41.33 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.06 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  43.63 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4323  aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
503 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
490 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0515  aldehyde dehydrogenase  41.84 
 
 
511 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.423959  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 
488 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.39 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
493 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
493 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  38.67 
 
 
503 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  41.11 
 
 
493 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2524  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.35 
 
 
509 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.70277  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  41.5 
 
 
488 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3284  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
487 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0847385  normal  0.0581994 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
488 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4233  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
487 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4133  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.48 
 
 
487 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.086214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  41.56 
 
 
493 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1781  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
487 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3822  Aldehyde Dehydrogenase  41.47 
 
 
498 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.21672  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3524  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
505 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00723314  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  39.86 
 
 
495 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6756  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.569452 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
488 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
494 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
494 aa  309  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4372  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  41.06 
 
 
487 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2213  aldehyde dehydrogenase  42.07 
 
 
490 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00475065  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6123  aldehyde dehydrogenase  43.87 
 
 
489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>