More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6185 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  58.91 
 
 
554 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
555 aa  1130    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  62.5 
 
 
566 aa  673    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.85 
 
 
557 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.96 
 
 
561 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.66 
 
 
568 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  57.12 
 
 
568 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.85 
 
 
568 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  59.43 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  57.48 
 
 
568 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.39 
 
 
575 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  57.48 
 
 
568 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  56.57 
 
 
568 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.39 
 
 
568 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  56.57 
 
 
568 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  56.57 
 
 
568 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.39 
 
 
568 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.02 
 
 
568 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  56.39 
 
 
568 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.39 
 
 
568 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.92 
 
 
563 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.39 
 
 
568 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  56.39 
 
 
568 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  55.56 
 
 
566 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.64 
 
 
555 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  55.74 
 
 
566 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.39 
 
 
552 aa  551  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.87 
 
 
553 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.42 
 
 
582 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  51.55 
 
 
554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.18 
 
 
559 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  48.18 
 
 
556 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.56 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  43.35 
 
 
552 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  27.48 
 
 
482 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  24.95 
 
 
496 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  30.45 
 
 
502 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0074  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.73 
 
 
530 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  24.17 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0290  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.61 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.48 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  25.21 
 
 
996 aa  80.1  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.87 
 
 
993 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0340  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0338  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0367  aldehyde dehydrogenase family protein  24.64 
 
 
481 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0279  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0282  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0309  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0381  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0289  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0295  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.83 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0355  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.39 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4965  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.39 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.46 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.95 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4420  Aldehyde Dehydrogenase  28.21 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.95 
 
 
487 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5334  vanillin: NAD oxidoreductase  25.44 
 
 
510 aa  77  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4113  Aldehyde Dehydrogenase  27.24 
 
 
504 aa  77  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0274  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.55 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.84 
 
 
991 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  24.56 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1043  1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.05 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.6 
 
 
1001 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  24.81 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0352  aldehyde dehydrogenase  25.25 
 
 
499 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  22.81 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.73 
 
 
993 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.15 
 
 
1006 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.84 
 
 
991 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5622  putative aldehyde dehydrogenase  26.76 
 
 
489 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  27.24 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  22.5 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17510  L-proline dehydrogenase /delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  25.92 
 
 
1203 aa  74.3  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3316  aldehyde dehydrogenase  24.89 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.47 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  26.08 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  23.57 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  24.46 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1728  Aldehyde Dehydrogenase  24.42 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193131  normal  0.860615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  23.62 
 
 
503 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3126  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.72 
 
 
515 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187882  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.11 
 
 
487 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  23.84 
 
 
497 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4836  aldehyde dehydrogenase  25.13 
 
 
474 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00630239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3849  aldehyde dehydrogenase  24.15 
 
 
476 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  22.95 
 
 
476 aa  73.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.4 
 
 
487 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.4 
 
 
487 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  26.33 
 
 
478 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
489 aa  72  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4341  aldehyde dehydrogenase  24.42 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  24.03 
 
 
493 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1577  aldehyde dehydrogenase  24.14 
 
 
476 aa  72  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750441  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  26.33 
 
 
478 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.9 
 
 
1221 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  26.33 
 
 
478 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00811  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  26.26 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>