More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3362 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0904  phenylacetic acid degradation protein paaN  78.66 
 
 
553 aa  798    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3362  phenylacetic acid degradation protein paaN  100 
 
 
553 aa  1113    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4798  phenylacetic acid degradation protein paaN  60.43 
 
 
559 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.484445  normal  0.252551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3740  phenylacetic acid degradation protein paaN2  53.71 
 
 
554 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0891249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2900  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.88 
 
 
568 aa  528  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000137012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6185  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.83 
 
 
555 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1513  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.72 
 
 
555 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1901  aldehyde dehydrogenase family protein  51.44 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0596942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0543  aldehyde dehydrogenase family protein  51.44 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000511741  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0634  aldehyde dehydrogenase family protein  51.44 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000013485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3573  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.44 
 
 
568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3546  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.26 
 
 
568 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000144132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3564  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.08 
 
 
568 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000332176  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2689  phenylacetic acid degradation protein paaN  52.62 
 
 
563 aa  515  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000855846  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0931  aldehyde dehydrogenase family protein  51.26 
 
 
568 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000213032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2197  phenylacetic acid degradation protein paaN  53.99 
 
 
566 aa  511  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3630  phenylacetic acid degradation protein paaN2  51.63 
 
 
568 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000209323  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0515  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.63 
 
 
568 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000855749  normal  0.271248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4493  phenylacetic acid degradation protein paaN  50 
 
 
557 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0543  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.99 
 
 
568 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0023429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2562  phenylacetic acid degradation protein paaN2  51.99 
 
 
568 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.945881  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0473  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.81 
 
 
568 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000197597  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2851  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.45 
 
 
568 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000806578  normal  0.567256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0448  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.99 
 
 
568 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.024942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0808  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.09 
 
 
552 aa  491  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464517  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0265  phenylacetic acid degradation protein paaN  49.64 
 
 
561 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3486  phenylacetic acid degradation protein paaN  51.89 
 
 
566 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000217108  hitchhiker  0.00037416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0470  phenylacetic acid ring-opening protein (PaaZ')  52.26 
 
 
566 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566882  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0307  phenylacetic acid degradation protein paaN  50 
 
 
557 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777048  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6112  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.46 
 
 
575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.771737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0370  phenylacetic acid degradation protein paaN2  49.01 
 
 
554 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52975e-18  unclonable  0.0000000651019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1136  phenylacetic acid degradation protein paaN  42.83 
 
 
552 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.368939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1435  phenylacetic acid degradation protein paaN  45.41 
 
 
556 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01930  phenylacetic acid degradation protein paaN  47.13 
 
 
582 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2450  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.62 
 
 
496 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.389244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1776  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.05 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.51 
 
 
487 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3847  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  24.75 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.794962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1842  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.78 
 
 
476 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0594  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2843  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2724  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2422  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00496  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.3 
 
 
489 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.787111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2782  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.71 
 
 
487 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4340  aldehyde dehydrogenase  25.9 
 
 
513 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0524218  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4666  aldehyde dehydrogenase  25.98 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260999  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4578  aldehyde dehydrogenase  25.98 
 
 
489 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  27.12 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2869  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  30.64 
 
 
405 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2121  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.73 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1784  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  26.57 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  26.11 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1420  aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
531 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0677446  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2699  aldehyde dehydrogenase  28.66 
 
 
531 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4961  aldehyde dehydrogenase  25.68 
 
 
489 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5389  aldehyde dehydrogenase  26.7 
 
 
493 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4294  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.58 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2580  Aldehyde Dehydrogenase  24.02 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0634  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  24.16 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1778  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.79 
 
 
487 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0546106  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5157  aldehyde dehydrogenase  24.46 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204218  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  26.73 
 
 
679 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1548  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  23.16 
 
 
516 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  22.47 
 
 
993 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1160  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.86 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16373  normal  0.0712177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  25.15 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1183  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.58 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0470071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0704  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.58 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1682  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0094  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  27.39 
 
 
688 aa  73.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1677  aldehyde dehydrogenase  25.58 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  25.76 
 
 
478 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1797  aldehyde dehydrogenase  25.94 
 
 
474 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.762347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10783  aldehyde dehydrogenase NAD dependent aldA  27.38 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1064  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  27.54 
 
 
487 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.35 
 
 
991 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2045  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  25.96 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3878  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.18 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.35 
 
 
991 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0573  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  25.18 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.542951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1600  aldehyde dehydrogenase  24.66 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1967  L-sorbosone dehydrogenase, NAD(P) dependent  25.96 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  24.63 
 
 
991 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  26.75 
 
 
684 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0895  aldehyde dehydrogenase  27.71 
 
 
531 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.335826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1763  aldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688744  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1828  aldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4953  aldehyde dehydrogenase  24.24 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1781  aldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 
513 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3125  aldehyde dehydrogenase  26.9 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  27.23 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0874  aldehyde dehydrogenase  26.02 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1486  aldehyde dehydrogenase  30.71 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>