More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1698 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1698  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 373 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1903  polyamine ABC transporter system, substrate-binding protein  65.8 
 
 		 376 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0765034  normal  0.376204 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1736  extracellular solute-binding protein  66.29 
 
 		 375 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000683653 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2377  extracellular solute-binding protein family 1  57.46 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0307958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2095  extracellular solute-binding protein  54.68 
 
 		 385 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0550638  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0352  extracellular solute-binding protein  52.16 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000218396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2862  extracellular solute-binding protein  52.63 
 
 		 386 aa  358  8e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6418  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  49.17 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  49.17 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  49.17 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  48.89 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  48.89 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  48.89 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  48.89 
 
 		 484 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  49.16 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 364 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  49.16 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  48.88 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  48.6 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  48.03 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  47.97 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  46.88 
 
 		 367 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0103  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.61 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  46.88 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  48.55 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  46.83 
 
 		 366 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3009  extracellular solute-binding protein  47.51 
 
 		 366 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.274617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  47.09 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  47.09 
 
 		 387 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  46.81 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  48.2 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  46.54 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 		 366 aa  332  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.25 
 
 		 366 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  47.55 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2990  extracellular solute-binding protein  47.85 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  47.83 
 
 		 365 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6181  extracellular solute-binding protein family 1  44.75 
 
 		 369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  46.13 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  45.43 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2996  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 		 371 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2382  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 		 371 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.721841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  47.15 
 
 		 365 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  45.15 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.49 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  45.15 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3015  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.946307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  45.15 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2905  extracellular solute-binding protein  47.28 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6065  extracellular solute-binding protein  46.67 
 
 		 373 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  45.98 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  47.27 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6345  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.4 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0940  ABC putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein PotF  46.13 
 
 		 373 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147346  normal  0.325606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3043  extracellular solute-binding protein  46.7 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2642  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  47.12 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00909614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03930  polyamine transport protein  46.26 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  46.03 
 
 		 365 aa  319  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4664  extracellular solute-binding protein family 1  45.86 
 
 		 373 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.969317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2020  putrescine ABC transport system, binding exported protein  47.63 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0726  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.63 
 
 		 409 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6638  extracellular solute-binding protein family 1  44.66 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0634  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.63 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1948  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  47.34 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  45.63 
 
 		 365 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7565  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.92 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132158  normal  0.536425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  45.58 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  44.6 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7683  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  47.56 
 
 		 373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  46.69 
 
 		 375 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0310  extracellular solute-binding protein  44.26 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7525  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.85 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  46.4 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  46.4 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0407  extracellular solute-binding protein family 1  48.5 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000173672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3260  extracellular solute-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  43.21 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  44.82 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  45.72 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  43.77 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  43.77 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  43.8 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  45.03 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0873  periplasmic polyamine-binding protein, putative  43.85 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  45.03 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 367 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0346  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  44.48 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0903  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.551806  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  44.75 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4305  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2785  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  43.06 
 
 		 359 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0573918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4864  extracellular solute-binding protein  46.51 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29090  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  43.13 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0282  extracellular solute-binding protein  45.82 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443093  normal  0.882806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>