More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4305 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  40.78 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  39.43 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  37.5 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  39.26 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  39.26 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  37.38 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  40.2 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  35.49 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  36.27 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  37.67 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  37.54 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  33.11 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  35.74 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  35.84 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  36.88 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  36.73 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  36.05 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  36.21 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  39.6 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  38.1 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  34.32 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  37.04 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  36.2 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  34.59 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.8 
 
 		 333 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.19 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.85 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  38.05 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  32.5 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  35.52 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.11 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  33.12 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.38 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.25 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  34.39 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  33.12 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 		 330 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  32.81 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  35.49 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  31.76 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  33.54 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  34.63 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.05 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.3 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  32.99 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5147  extra-cytoplasmic solute receptor  33.77 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.698563  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  33.56 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  31.6 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  33.56 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3573  hypothetical protein  35.03 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  31.97 
 
 		 336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.47 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  32.88 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  31.97 
 
 		 353 aa  162  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  32.99 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.01 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  33.68 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  34.59 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  33.67 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  32.99 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  34.2 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  31.63 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  31.05 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  33.97 
 
 		 329 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  29.63 
 
 		 328 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  33.68 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  33.68 
 
 		 327 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4432  hypothetical protein  35.95 
 
 		 324 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0142  hypothetical protein  34.01 
 
 		 348 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.11669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  31.63 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  30.72 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  31.27 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  33.98 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  34.05 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  35.57 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  32.54 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  32.2 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  33.94 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.38 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  33.22 
 
 		 349 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  33.66 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  31.29 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  32.31 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  32.31 
 
 		 349 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  32.92 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  32.79 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  34.26 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  31.76 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  30.96 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  31.49 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  32.56 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  35.56 
 
 		 325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  33.67 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>