More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0073 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  76.36 
 
 		 329 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  74.02 
 
 		 331 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  76.36 
 
 		 331 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  65.75 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  67.88 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  51.07 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  52.71 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  49.54 
 
 		 328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  48.94 
 
 		 330 aa  311  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  47.4 
 
 		 329 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  44.16 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  39.81 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  38.89 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  37.12 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  38.2 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.06 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.72 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  36.92 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  36.92 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  36.53 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  36.24 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.05 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  38.72 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  37.04 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  37.29 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  35.45 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.18 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.52 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  35.76 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.17 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.06 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.67 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.03 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.06 
 
 		 327 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.18 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  36.2 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.78 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  34.66 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.35 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  37.76 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  36.73 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  35.45 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  38.36 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  35.67 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  36.24 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.05 
 
 		 346 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.98 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.1 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  35.35 
 
 		 325 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  33.89 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  34.02 
 
 		 339 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.77 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  35.65 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  34.04 
 
 		 330 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.77 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  35.69 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  34.65 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.79 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  36.31 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  33.55 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  34.68 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.02 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.29 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.71 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  35 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  38.81 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  34.3 
 
 		 349 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  38.83 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  36.42 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  34.05 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  37.33 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  37.93 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.88 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  35.98 
 
 		 333 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  38.83 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.69 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  36.52 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  35.08 
 
 		 698 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.05 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  33.76 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.45 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  34.58 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  37.8 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.35 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  35.22 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  36.9 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.34 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  34.45 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  37.71 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.75 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  36.7 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  35.52 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.35 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  33.03 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>