More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4796 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  49.23 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  38.39 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  38.39 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  35.35 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  36.53 
 
 		 321 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  35.56 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  36.3 
 
 		 343 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  35.69 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  35.81 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  35.93 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  36.27 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  36.25 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  35.23 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  35.23 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.23 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  32.83 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  34.46 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.14 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  34.35 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.45 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  35.91 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.56 
 
 		 358 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  33.67 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  33.11 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  34.92 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  32.92 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  33.67 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  32.36 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  36.36 
 
 		 329 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  33.56 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  33.45 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.08 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  31.74 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  32.66 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.77 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  31.76 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  31.39 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  33.45 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  34.11 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  33.45 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  31.31 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  31.08 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  34.47 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  32.42 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  31.08 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  32.42 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  34.32 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  33.69 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  34.15 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  30.3 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  33.78 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  34.57 
 
 		 330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  34.23 
 
 		 329 aa  165  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  33.45 
 
 		 328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  31.76 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  35.14 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  32.66 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  34.46 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.27 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  31.34 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  32 
 
 		 322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  33.56 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  32.93 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  32.3 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  31.99 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.14 
 
 		 330 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  32.19 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  32.43 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  33.86 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  31.76 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  32.09 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  32.61 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  31.89 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  33.79 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  29.75 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  33.45 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  30.27 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  32.18 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  32.88 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  32.21 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  30.09 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  31.19 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  31.02 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  31.77 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  36.21 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  31.77 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  30.64 
 
 		 355 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  30.98 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>