More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0142 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0142  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  703    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.11669  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0141  hypothetical protein  87.95 
 
 
359 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.811202  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  42.42 
 
 
329 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  42.42 
 
 
329 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.78 
 
 
331 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.86 
 
 
326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.18 
 
 
337 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  41.39 
 
 
337 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  41.95 
 
 
335 aa  222  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.88 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.34 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.33 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  39.74 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 
331 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.7 
 
 
324 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  40.07 
 
 
334 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.8 
 
 
328 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.21 
 
 
322 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.67 
 
 
323 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  39.4 
 
 
328 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39 
 
 
337 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.81 
 
 
325 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.75 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  39.06 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  39.81 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.75 
 
 
325 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  41.16 
 
 
322 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.27 
 
 
338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.21 
 
 
330 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  42.14 
 
 
339 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.46 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  40.8 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  42.95 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.46 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.21 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.06 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  41.28 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.36 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.7 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.7 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.76 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.21 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  38.33 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  40.27 
 
 
420 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.91 
 
 
324 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3059  hypothetical protein  40.52 
 
 
329 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.0348816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  42.51 
 
 
328 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39 
 
 
355 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  39.2 
 
 
328 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.33 
 
 
353 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.13 
 
 
333 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.19 
 
 
327 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  39.46 
 
 
324 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  39.74 
 
 
328 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.78 
 
 
331 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  38.57 
 
 
325 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.26 
 
 
323 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.75 
 
 
322 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.67 
 
 
335 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.24 
 
 
336 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.81 
 
 
351 aa  208  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.87 
 
 
327 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  39.73 
 
 
338 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  38.21 
 
 
330 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  38.46 
 
 
326 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  39.93 
 
 
340 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  41.22 
 
 
332 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  37.61 
 
 
327 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.38 
 
 
343 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  37.75 
 
 
322 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.85 
 
 
330 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.66 
 
 
349 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 
335 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  40.93 
 
 
349 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  36.7 
 
 
322 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38 
 
 
356 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.13 
 
 
333 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.33 
 
 
330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  38.91 
 
 
325 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.78 
 
 
339 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  37.17 
 
 
326 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.54 
 
 
322 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.54 
 
 
327 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  36.26 
 
 
334 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.81 
 
 
325 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.41 
 
 
331 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.04 
 
 
328 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38 
 
 
310 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  36.33 
 
 
333 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.24 
 
 
698 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.28 
 
 
334 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.39 
 
 
339 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.08 
 
 
330 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  35.23 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.34 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  37.21 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.87 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  35.23 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>