More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1950 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  74.09 
 
 		 324 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  73.48 
 
 		 324 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  71.62 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  65.96 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  68.71 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  62.42 
 
 		 330 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  40.61 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  39.4 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  37.39 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  37.69 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  35.06 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  37.12 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.5 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.06 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  37.27 
 
 		 329 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  36.27 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  39.8 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.67 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  38.6 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  34.95 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  33.9 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.24 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  35.08 
 
 		 335 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.11 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  36.21 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.05 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  35.31 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.96 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  37.16 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  34.77 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  33.44 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  35.74 
 
 		 329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.45 
 
 		 344 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  36.7 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  35.22 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  34.77 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.35 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  33.95 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.76 
 
 		 330 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.4 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  34.76 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  34.69 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  30.86 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.24 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  33.88 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  37.07 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  34.97 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  36.16 
 
 		 335 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  31.8 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  31.58 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  32.82 
 
 		 327 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.21 
 
 		 366 aa  175  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  37.11 
 
 		 339 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  32.41 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.77 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  31.51 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  35.66 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  32.76 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  35.56 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  34.43 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  35.71 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  36.02 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  35.86 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  35.74 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  33.54 
 
 		 334 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  33.67 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  33.03 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.12 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  34.71 
 
 		 355 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0277  hypothetical protein  33.55 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  33.84 
 
 		 328 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  32 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  36.73 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  34.57 
 
 		 327 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4067  extra-cytoplasmic solute receptor  35.47 
 
 		 325 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0118561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  31.65 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  32.65 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  33.45 
 
 		 349 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  31.08 
 
 		 324 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  32.47 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  33.12 
 
 		 305 aa  169  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  35.89 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.55 
 
 		 322 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  33.44 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  32.78 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  34.03 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  30.79 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  32.01 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  33.02 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  31.49 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  31.79 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  31.83 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  33.44 
 
 		 349 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  33.22 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>