More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2145 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.52 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  41.23 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.87 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.23 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.01 
 
 		 327 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.82 
 
 		 344 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  41.06 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  42.23 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.78 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.38 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.6 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.27 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.33 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  42.11 
 
 		 339 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.12 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.12 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  41.75 
 
 		 330 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  39.16 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  42.91 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.07 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.63 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  44.1 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.07 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.73 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.12 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  40.41 
 
 		 360 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  37.27 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.76 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  42.71 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  38.83 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.31 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.92 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.92 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  38.39 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  40.59 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  39.38 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.28 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  37.99 
 
 		 698 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.66 
 
 		 334 aa  222  7e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  42.43 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  40.97 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  41.44 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.38 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  42.81 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.56 
 
 		 337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  38.97 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.04 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  40.19 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  39.86 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  38.11 
 
 		 339 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  39.88 
 
 		 341 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.65 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.45 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.67 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.17 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  43.85 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  41.38 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.81 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  40.37 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.14 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  40.75 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  41.14 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.34 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  40.14 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.13 
 
 		 333 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  40.62 
 
 		 332 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  41.41 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.38 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  40.69 
 
 		 326 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  39.3 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  37.21 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.95 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.24 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1601  hypothetical protein  38.62 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0236612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.19 
 
 		 358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  39.24 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  39.25 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.97 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  37.33 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3823  hypothetical protein  39.52 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.58 
 
 		 322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  39.79 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  38.62 
 
 		 353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  38.01 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  36.05 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  38.36 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1728  hypothetical protein  38.97 
 
 		 324 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000138384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.91 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  39.94 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  39.2 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.32 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.86 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  38.97 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>