More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5978 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  41.32 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  41.39 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  42.48 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  39 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  40.48 
 
 		 328 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  37.07 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  38.49 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  39.1 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  33.87 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.66 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  37.54 
 
 		 386 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37.65 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.49 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  33.54 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  36.61 
 
 		 355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3341  hypothetical protein  34.93 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0035025  normal  0.828931 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  34.6 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  32.69 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  33.54 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.64 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  33.13 
 
 		 335 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.2 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  32.28 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  35.4 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  32.08 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  35.29 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.83 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  33.9 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.83 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  31.66 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  35.53 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.59 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  31.97 
 
 		 337 aa  159  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  32.42 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.25 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.74 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  33.73 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.41 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.77 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  33.11 
 
 		 329 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  33.54 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  33.55 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  30.82 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  31.4 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  32.88 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.71 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  31.68 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  34.03 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  32.88 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  32.55 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  32.89 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  34.69 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  32.01 
 
 		 328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  34.71 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.91 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1400  hypothetical protein  34.25 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  30.79 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  30.75 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.48 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  30.67 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  31.38 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.02 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  30.84 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  34.15 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  27.95 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  37.07 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  34.01 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  35.54 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.11 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  33.99 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  33.11 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  33.82 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  31.83 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  32.32 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1024  hypothetical protein  29.03 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  29.85 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  30.33 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  31.36 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  34.6 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  31.6 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  37.3 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  30.58 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  33.87 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  35.35 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  33.68 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  31.85 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  32.93 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  33.02 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  36.23 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  29.62 
 
 		 324 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>