More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5792 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5792  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  57.8 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  56.7 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  51.11 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  49.66 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4082  hypothetical protein  51.2 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  37.58 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  35.45 
 
 		 333 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5978  hypothetical protein  34.15 
 
 		 327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665972  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  33.23 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  34.06 
 
 		 328 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  33.73 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  34.58 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  33.54 
 
 		 330 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  32.76 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  31.8 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  35.44 
 
 		 330 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  35.35 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  33.13 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  31.15 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  31.89 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  33.95 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  33.22 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  31.5 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  33.64 
 
 		 324 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  33.99 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  32.43 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  33.95 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5175  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1838  hypothetical protein  32.41 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  30.06 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  32.8 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  32.65 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  32.19 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  33.75 
 
 		 698 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  29.88 
 
 		 324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  32.06 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0990  twin-arginine translocation pathway signal  32.18 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  29.72 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  30.56 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  30.79 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  29.85 
 
 		 327 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0880  hypothetical protein  32.29 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.824369  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  31.69 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  31.09 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  29.62 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  29.81 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  31.31 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  33.13 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  30.15 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  31.38 
 
 		 328 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  33.76 
 
 		 330 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  33.71 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  33.1 
 
 		 420 aa  135  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  32.82 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  32.2 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  30.53 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  31.96 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  32.09 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  30.25 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  29.41 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  35.29 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  30.6 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  30.06 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  32.41 
 
 		 339 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  29.19 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  30.45 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  30.67 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  30.28 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  30.18 
 
 		 337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  30.45 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  31.08 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  30.97 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2841  hypothetical protein  31.21 
 
 		 325 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.013507  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  31.62 
 
 		 343 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4415  extra-cytoplasmic solute receptor  34.37 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.597884  normal  0.464948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  30.43 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  32.88 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  30.19 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  31.27 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  30.1 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  29.94 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2834  hypothetical protein  32.65 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421115  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4135  hypothetical protein  29.68 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118225  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  30.21 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4844  hypothetical protein  28.92 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  30.95 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0971  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.694014  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  30.77 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  31.62 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  29.47 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6277  hypothetical protein  31.85 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  31.1 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  29.79 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  31.16 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>