136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1941 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 113 aa  227  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  49.37 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  45.24 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  46.84 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  46.24 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  51.39 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  45 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  46.91 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  50.72 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  39.8 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  40.79 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  45.98 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  38.75 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  31.58 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2300  protein translocase subunit yajC  39.29 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0562615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  34.65 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  40.62 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  37.04 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  41.77 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  33.73 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  34.48 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1067  preprotein translocase, YajC subunit  31.65 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  33.77 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  37.21 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  37.21 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 		 93 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  31.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  32.99 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  34.07 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0715  preprotein translocase, YajC subunit  23.75 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  32.63 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  33.72 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  35.8 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  39.24 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  32.05 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  34.41 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  35.14 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  34.62 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  27.03 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  32.26 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  27.12 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  30.95 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  33.73 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  34.15 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  34.18 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  29.41 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  35.9 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  32.18 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  31.03 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  34.18 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  31.52 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  28.21 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  30.95 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  27.16 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35.9 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  29.89 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  31.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  34.04 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  35.44 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  30.12 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>