199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3825 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  100 
 
 
123 aa  248  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  41.46 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  46.84 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  40.79 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  36.96 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  36.56 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  38.04 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.84 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  39.24 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  36.96 
 
 
118 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  35.29 
 
 
129 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  42.11 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  39.76 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  32.5 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  30.47 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  30.08 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
102 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6327  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  35.11 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  35.44 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  32.69 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  32.38 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  36.11 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  41.89 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  32.99 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 
106 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  37.14 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6249  preprotein translocase, YajC subunit  33.66 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  34.95 
 
 
179 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  33.78 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 
110 aa  52  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  32.93 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  29.58 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4927  preprotein translocase, YajC subunit  46.38 
 
 
84 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.354289  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  29.35 
 
 
135 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0420  hypothetical protein  41.67 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  29.06 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  33.78 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  32.65 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  37.33 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  35.14 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  38.46 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  30.26 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  31.17 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  34.25 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 
91 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  26.47 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  34.72 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  32.71 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  35.06 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  28.71 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  31 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  34.57 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  34.15 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  30.26 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  30.12 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  30.67 
 
 
109 aa  48.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  34.92 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  30.77 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  32.47 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  28.26 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  30.67 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  27.59 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  33.78 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  33.77 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  29.87 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  35.56 
 
 
132 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>