298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2714 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 		 109 aa  218  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  86.24 
 
 		 110 aa  173  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  86.24 
 
 		 110 aa  173  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  80.73 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  78.7 
 
 		 108 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 109 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  70.64 
 
 		 107 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  69.72 
 
 		 107 aa  153  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  67.89 
 
 		 109 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  67.89 
 
 		 120 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  69.72 
 
 		 108 aa  146  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  143  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  73.63 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  66.06 
 
 		 108 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  75.28 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  70 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  66.04 
 
 		 108 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  64.04 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  61.8 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  60.67 
 
 		 91 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  63.22 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  63.22 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  59.34 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  56.84 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  59.09 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  57.95 
 
 		 93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  57.95 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  56.67 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  56.19 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  55.24 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  60 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  54.44 
 
 		 113 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  57.69 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  49.06 
 
 		 168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  54.95 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  49.54 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  49.54 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  49.04 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  52.75 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  52.75 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  45.79 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  47.32 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  51.43 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  41.96 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  44.64 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  41.96 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  41.96 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  41.96 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  55.42 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.73 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.96 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  44.64 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  53.19 
 
 		 102 aa  99.4  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  44.64 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  44.04 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  51.11 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 		 109 aa  96.7  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  47.78 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  48.11 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  58.75 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  58.75 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40.18 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.55 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  53.75 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  55 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  41.12 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>