295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3886 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  83.87 
 
 		 94 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  80.9 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  75.56 
 
 		 91 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  77.78 
 
 		 110 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  77.78 
 
 		 109 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  74.44 
 
 		 92 aa  139  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  71.11 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  69.66 
 
 		 108 aa  135  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  68.89 
 
 		 91 aa  131  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  63.64 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 108 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  58.89 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  57.95 
 
 		 109 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  57.78 
 
 		 109 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  55.56 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  57.95 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  55.68 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  57.95 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  56.82 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  62.92 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  57.95 
 
 		 108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  59.55 
 
 		 108 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  53.41 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  46.51 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  45.56 
 
 		 114 aa  97.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  58.67 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  50.6 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  49.4 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  44.83 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  43.68 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  46.51 
 
 		 168 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  50.6 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 108 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  46.59 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  50.57 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  50.57 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  45.35 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  45.35 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  46.07 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  44.83 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  49.37 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  48.68 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  48.68 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  43.18 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  49.38 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  46.43 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  41.46 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  47.62 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  43.04 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  45 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  48.65 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  37.93 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  40.24 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  40.24 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  35.87 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  35.87 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  35.87 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  41.46 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  43.68 
 
 		 93 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  38.46 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1276  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  39.77 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>