287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1179 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  43.64 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  43.64 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  43.64 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  44.35 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  43.24 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  44.14 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  45.05 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  40.71 
 
 		 110 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  40.18 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  46.07 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  38.94 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  38.94 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  38.94 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  44.94 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  42.2 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  39.82 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  41.44 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  41.44 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  38.94 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  43.01 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  43.01 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  42.71 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  40.35 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  40.35 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  39.47 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  46.15 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  38.74 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  40.86 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  44.87 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  38.6 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  41.86 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  38.74 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  43.82 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  43.96 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  42.39 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  40.86 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  38.32 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  46.15 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  41.57 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  41.57 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  40.71 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  34.23 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  35.4 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  39.05 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  41.57 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>