297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2058 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
111 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 
109 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  46.36 
 
 
120 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  45.87 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  48.6 
 
 
108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  48.11 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  48.62 
 
 
109 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  46.74 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  52.69 
 
 
106 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  47.83 
 
 
108 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  52.17 
 
 
114 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  51.43 
 
 
111 aa  103  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.4 
 
 
108 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 
106 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  54.76 
 
 
109 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  48.31 
 
 
127 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  44.64 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  44.34 
 
 
108 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
91 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  46.74 
 
 
108 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  45.28 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  51.81 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  53.57 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  53.57 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  48.45 
 
 
120 aa  95.9  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  46.51 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  46.51 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  47.19 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  49.48 
 
 
106 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 
92 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 
111 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  43.81 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 
123 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  54.43 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  40.19 
 
 
110 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  47.73 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  40.19 
 
 
110 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  48.75 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  40.57 
 
 
109 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 
111 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 
112 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  47.06 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
108 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  45.88 
 
 
168 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
110 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  40.22 
 
 
109 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  42.05 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2351  preprotein translocase subunit, YajC  48.11 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  46.84 
 
 
114 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1109  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
108 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0033679  normal  0.183773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  43.93 
 
 
109 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
120 aa  84.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  39.42 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  39.56 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  44 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  39.64 
 
 
110 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1276  protein translocase subunit yajC  45.98 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142603  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  47.56 
 
 
94 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  38.74 
 
 
110 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  50.65 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  44.55 
 
 
110 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 
110 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  40.2 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>