298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3408 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
108 aa  214  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  67.59 
 
 
108 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  66.97 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  66.97 
 
 
110 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  65.74 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  64.81 
 
 
108 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  57.94 
 
 
109 aa  135  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  66.97 
 
 
109 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  57.01 
 
 
107 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  55.14 
 
 
120 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  63.55 
 
 
108 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  55.14 
 
 
109 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  64.37 
 
 
108 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 
110 aa  120  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  60.67 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  57.01 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 
108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  60.67 
 
 
91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  56.6 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  60.75 
 
 
108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  53.26 
 
 
106 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  58.56 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  59.55 
 
 
91 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  59.14 
 
 
117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  57.95 
 
 
94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  53.41 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  52.33 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  53.33 
 
 
106 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  58.33 
 
 
109 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  55.91 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  50.47 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  57.14 
 
 
92 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  61.73 
 
 
114 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  52.34 
 
 
108 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  49.07 
 
 
109 aa  103  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  54.76 
 
 
113 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  50.94 
 
 
120 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  57.69 
 
 
91 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  51.82 
 
 
120 aa  100  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  43.01 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  45.37 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  43.01 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  59.52 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  43.86 
 
 
110 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  51.92 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  42.98 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  42.98 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
110 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  41.75 
 
 
110 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  61.25 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  61.25 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  46.15 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50.96 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  41.23 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  41.23 
 
 
110 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  45.71 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  42.31 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.57 
 
 
109 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  44.57 
 
 
111 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  44.57 
 
 
111 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  41.23 
 
 
110 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  58.75 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  60 
 
 
111 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  58.75 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  58.75 
 
 
111 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  58.75 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2351  preprotein translocase subunit, YajC  44.86 
 
 
111 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  43.81 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.73 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  57.5 
 
 
111 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  50.65 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  53.95 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  50.65 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40.18 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  48.31 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  52.44 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 
109 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  44.33 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>