296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1770 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  100 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  84.21 
 
 		 133 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  81.08 
 
 		 118 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  80.17 
 
 		 144 aa  192  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  68.49 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  63.01 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  68.53 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  60.75 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  59.81 
 
 		 113 aa  139  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  56.88 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  59.81 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  61.47 
 
 		 110 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  63.39 
 
 		 115 aa  136  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  57.94 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  57.94 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  61.95 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  57.27 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  55.65 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  60.22 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  55.36 
 
 		 111 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  57.41 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  52.08 
 
 		 104 aa  110  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  63.86 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  53.27 
 
 		 105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  51.61 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  55.14 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  55.14 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  54.78 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  57.94 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  53.49 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  41.74 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  53.49 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  51.4 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  44.07 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  42.72 
 
 		 109 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  46.6 
 
 		 107 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  42.57 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  44.63 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  47.78 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  48.86 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40.78 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40.78 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  43.96 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  42 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  43.4 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  41.35 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  38.46 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  53.62 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  39.39 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  36.13 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  39.42 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  53.62 
 
 		 106 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  39.42 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  42.71 
 
 		 103 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  39.18 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  35.92 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  44 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  39.77 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  39.6 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  37.61 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>