299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3173 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
146 aa  294  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  77.55 
 
 
146 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  72.11 
 
 
144 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  78.08 
 
 
142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  82.73 
 
 
118 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  67.81 
 
 
133 aa  193  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  78.7 
 
 
133 aa  185  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  64.29 
 
 
114 aa  139  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  57.66 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  58.56 
 
 
113 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  58.77 
 
 
111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  56.76 
 
 
110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  56.76 
 
 
113 aa  135  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  62.93 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  59.46 
 
 
111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  56.88 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  56.88 
 
 
110 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  57.14 
 
 
111 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  52.63 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  59.55 
 
 
110 aa  116  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  60.19 
 
 
111 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  55.79 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  44.96 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  58.82 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  58.82 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  54.63 
 
 
108 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  54.63 
 
 
108 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  54.12 
 
 
109 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  53.41 
 
 
93 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  50 
 
 
123 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
115 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  49.43 
 
 
94 aa  98.6  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  40.4 
 
 
154 aa  96.7  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  50.59 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  48.11 
 
 
127 aa  93.6  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  39.83 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  37.61 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  47.17 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 
111 aa  84.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39.05 
 
 
109 aa  84  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  39.05 
 
 
120 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  84  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  42.16 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  42.2 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  40.57 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  42.45 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.38 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  42.45 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  40.57 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  42.45 
 
 
111 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
108 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  40.37 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  39.62 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.51 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  38.68 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  37.74 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  37.14 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
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NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  41.67 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  43.68 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  39.51 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
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