282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3109 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  51.65 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  50.55 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  49.41 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  50.55 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  48.39 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  47.52 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  51.04 
 
 		 94 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  52.75 
 
 		 178 aa  93.6  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  47.78 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  46.6 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  43.62 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  45.98 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  50.59 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  51.76 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  41.84 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 107 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  42.55 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  42.55 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  48.24 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.68 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  43.62 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 109 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  45.78 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.53 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  44.32 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  42.05 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.57 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  40.66 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  38.61 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  43.68 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  43.82 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.61 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  36.67 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  39.6 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  38.54 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  40.7 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42.68 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  43.04 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  39.53 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  48.65 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  36.08 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 		 115 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  43.59 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  43.59 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  40.66 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  44 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  41.58 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  39.24 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>