282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2659 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  100 
 
 		 123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  74.78 
 
 		 115 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  73.91 
 
 		 115 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  63.64 
 
 		 110 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  57.14 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  55.36 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  54.46 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  50.41 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  50.41 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  50.89 
 
 		 118 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  51.85 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  60 
 
 		 111 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  51.75 
 
 		 110 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  49.12 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50 
 
 		 143 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  51.75 
 
 		 110 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  49.62 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  46.09 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  56.63 
 
 		 111 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  52.33 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  50.54 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  54.12 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  55.17 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  55.17 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  55.95 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  57.69 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  54.02 
 
 		 109 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  51.76 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  52.33 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  53.57 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  52.5 
 
 		 110 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  46.6 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.75 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  46.23 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  43.69 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  39.62 
 
 		 109 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  38.71 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  39.05 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  41.05 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  39.05 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  45.68 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  40.17 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  35.24 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  41.94 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1182  preprotein translocase, YajC subunit  47.42 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.714716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  41.51 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  37.14 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  35.24 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  36.19 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  40.43 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  31.48 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  33.02 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  33.03 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  40.21 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  36.79 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  39.81 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  36.79 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  36.79 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  42.45 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.61 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  38.24 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40.45 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  36.79 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>