291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1930 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  55.32 
 
 
121 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  48.51 
 
 
106 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  53.41 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  50.57 
 
 
119 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  43.69 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  52.29 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  44 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  49.5 
 
 
107 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  43.52 
 
 
108 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  37.38 
 
 
111 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  49.37 
 
 
106 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  41.96 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  46.05 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.36 
 
 
109 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40.54 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  42.05 
 
 
109 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  41.28 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 
105 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  52.78 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  40.78 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  43.88 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.81 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  41.98 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  40.7 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  52.11 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  46.73 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  40.74 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  39.64 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  38.46 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  39.8 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  39.8 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  40.74 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  38.38 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  43 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  46.75 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  44.83 
 
 
106 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 
111 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  37.25 
 
 
110 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  41.57 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  40.82 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.23 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 
110 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  45.24 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  39.77 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  46.84 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  45 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  45.33 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  45.33 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  39.25 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>