More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1340 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  64.42 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  61.86 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  53.54 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  52.54 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  52.94 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  43.55 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  51.55 
 
 		 106 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 		 107 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  46.23 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  44.63 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  47.67 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  54.02 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  49.44 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  49.44 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  48.24 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.05 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  44.76 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  44.83 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  46.07 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  49.41 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.17 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  44.14 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  39.34 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  43.16 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  48.15 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.83 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  47.87 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  45.12 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  43.69 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  56.67 
 
 		 108 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  50.72 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  42.17 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  41.77 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  46.91 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  39.05 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  43.01 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  43.01 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  43.01 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  40.43 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  37.11 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  41.98 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  42.39 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  42.35 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  44.58 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  39.36 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  39.66 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  34.62 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  42.55 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  41.76 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  37.25 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.51 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  40.95 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  45.26 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  37.72 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  37.72 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  41.76 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  44.05 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  34.96 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  40.57 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  45.26 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>