More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0680 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  57.39 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  61.62 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  63.86 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  57.89 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  49.52 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  48 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  50.93 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  47 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  44.12 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  42.42 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  44.23 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  48.19 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  45.12 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  44.71 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  48.68 
 
 		 93 aa  92.8  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  44.21 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  44.55 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  49.35 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  39.8 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  41.94 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  48.05 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  53.95 
 
 		 114 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.37 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1237  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1112  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  43.48 
 
 		 111 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0070  preprotein translocase subunit YajC  44.58 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  51.65 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  38.83 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  41.44 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  42.68 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  44.83 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  41.9 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0629  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  45.68 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 106 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  41.67 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  38.95 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0477  preprotein translocase subunit YajC  47.62 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  53.95 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  45.12 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  53.95 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  53.95 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  44.16 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  42 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.27 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  45.35 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  44.09 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  51.22 
 
 		 94 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  38.18 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1049  preprotein translocase subunit YajC  41.11 
 
 		 91 aa  84  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  39.8 
 
 		 118 aa  83.6  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 		 111 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  41.59 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  38.74 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  47.3 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  53.42 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  38.38 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>