295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0806 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
103 aa  206  9e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  49.49 
 
 
101 aa  101  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  44.94 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  40.78 
 
 
115 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  43.14 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  40.78 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  39.81 
 
 
115 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  38.89 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  44.3 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  40 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  41.57 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  42.39 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  41.3 
 
 
110 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  38.04 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
114 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  41.25 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
90 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  36.36 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  36.36 
 
 
92 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  38.64 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  39.77 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  41.3 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  41.3 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  41.67 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  37.08 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  32.22 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  35.8 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  40.22 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  40.22 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  40.22 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  40.22 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  40.78 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  43.37 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  31.11 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  39.19 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  37.97 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  37.62 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  34.07 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  37 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  40.96 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  42.17 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  42.17 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  38.71 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 
133 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 
114 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0706  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  39.51 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  33.71 
 
 
111 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  35.8 
 
 
94 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  34.78 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  31.4 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  36.89 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  38.95 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  40.96 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  42.47 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  34.07 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  44.74 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  42.67 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  32.95 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  35.37 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1576  preprotein translocase subunit YajC  39.24 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  44.07 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  39.76 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>