More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2809 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 		 108 aa  215  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  88.89 
 
 		 108 aa  179  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  82.41 
 
 		 110 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  82.41 
 
 		 110 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  86.52 
 
 		 109 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 109 aa  157  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  71.96 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  71.03 
 
 		 107 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  70.09 
 
 		 120 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  70.09 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  71.03 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  71.43 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  68.22 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  65.74 
 
 		 108 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  62.96 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  67.44 
 
 		 92 aa  127  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  63.04 
 
 		 108 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  63.04 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  63.04 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  63.22 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  62.79 
 
 		 94 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  62.07 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  59.26 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  61.36 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  56.82 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  55.79 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  58.89 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  52.25 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  52.25 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  53.15 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  54.65 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  55.32 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  52.73 
 
 		 120 aa  103  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  47.75 
 
 		 110 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  55.42 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  47.75 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  46.85 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  46.85 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  46.85 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  46.85 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  53 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  47.75 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  50.49 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  48.21 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  50.56 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  43.93 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  50.48 
 
 		 120 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  46.34 
 
 		 109 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  47.66 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  43.52 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 110 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1121  preprotein translocase subunit YajC  50.55 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  44.04 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  46.67 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  47.13 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42.59 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  51.81 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  44.23 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  49.45 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.68 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  46.23 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  49.35 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  42.34 
 
 		 123 aa  90.9  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  49.35 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  51.22 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  47.25 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  47.25 
 
 		 91 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  42.2 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  46.88 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  51.81 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>