More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1783 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  91.51 
 
 		 106 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  69.81 
 
 		 106 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  71.7 
 
 		 106 aa  151  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  75.9 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  72.5 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  65 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  53.33 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  51.02 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  52.38 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  62.67 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  52.87 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  49.41 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  50.6 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  44.33 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  55.56 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  44.33 
 
 		 109 aa  95.9  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  52.56 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  48.81 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  56.32 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  46.51 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  51.65 
 
 		 111 aa  94.7  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  52.56 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 92 aa  94.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  51.25 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  54.32 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  54.32 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  41.24 
 
 		 109 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  45.12 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  48.48 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.24 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  53.16 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  46.25 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  48.28 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  43.3 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  54.65 
 
 		 113 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  51.25 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 109 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 178 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  49.35 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48.24 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  47.5 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.59 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 		 112 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.9 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  47.44 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  47.44 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  46 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  44.9 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  46.08 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  48.31 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  46.07 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  48.86 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  52.11 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  42.57 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  46.08 
 
 		 116 aa  85.5  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 		 110 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  47.37 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2395  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115356  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  45.1 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2441  preprotein translocase, YajC subunit  56.25 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100189  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  44 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  45 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  38.68 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  45 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  46.51 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  41.3 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  41.98 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>