More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1417 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 110 aa  219  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  66.29 
 
 		 94 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  60.75 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  53.15 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  63.3 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  63.3 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  62.39 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  54.05 
 
 		 113 aa  120  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  60.67 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  53.27 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  50.45 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  61.8 
 
 		 93 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  47.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  47.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  50.91 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  54.46 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  46.49 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  50.94 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  51.4 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  47.83 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  66.23 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  66.23 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  48.51 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  49.49 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  60.76 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  48.48 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  51.4 
 
 		 110 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  49.48 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  53.26 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  54.88 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  56.47 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  50.98 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  58.75 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  51.96 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  51.96 
 
 		 110 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  51.49 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  48.18 
 
 		 110 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  56.79 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  51.55 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  51.09 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  58.44 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  49.53 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  57.5 
 
 		 92 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  51.06 
 
 		 114 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  51.81 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  49.53 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 143 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 146 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  51.25 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  44.55 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  42.73 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  41.23 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  60 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  50.62 
 
 		 108 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  48.86 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  45.65 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  47.96 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  51.81 
 
 		 113 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  55 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  58.82 
 
 		 91 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  49.38 
 
 		 106 aa  88.6  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  51.22 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  35.54 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  49.37 
 
 		 178 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  43.52 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  47.19 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  52.56 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  48.72 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  53.16 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  40.59 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  49.4 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>