296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1332 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  60.23 
 
 		 108 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  48.15 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  49.54 
 
 		 110 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  48.62 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  47.22 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  46.67 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  50.94 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  46.73 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  45.19 
 
 		 107 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  48.6 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  50.47 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  52.81 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  53.27 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  50.56 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  45.87 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  52.81 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  51.69 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  52.81 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  51.72 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  51.72 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  46.73 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  51.85 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  45.37 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  45.37 
 
 		 110 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  50.56 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  44.76 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  50 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  50.45 
 
 		 113 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  47.17 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  52.33 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  52.69 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  46.79 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  43.81 
 
 		 108 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  47.19 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  48.31 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  45.45 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  42.99 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  50.91 
 
 		 111 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  47 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  46.59 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  46.08 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  42.99 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  44.04 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  42.06 
 
 		 110 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  45.87 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  47.73 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  45.56 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  46.51 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  42.06 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  47.17 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  43.93 
 
 		 114 aa  91.3  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  53.85 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  43.93 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  42.73 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  42.73 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  41.12 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  51.19 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  42.45 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  55.26 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  41.12 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  48.81 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  40.19 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  40.19 
 
 		 110 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  48.6 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>