288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0682 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  45.37 
 
 		 109 aa  107  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  44.14 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  47.42 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  46.81 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  47.71 
 
 		 108 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  49.54 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  51.82 
 
 		 113 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  42.73 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  42.73 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  45.28 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  45.37 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  45.37 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  43.4 
 
 		 108 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  47.27 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00355  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3202  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.463836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0439  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00359  hypothetical protein  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0437  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  39.45 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0487  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  43.24 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  43.75 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  43.64 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  38.68 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  37.74 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  42.59 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2905  preprotein translocase, YajC subunit  43.64 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.653173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  45.45 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0326  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  41.44 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0465  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0446  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3290  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  48.31 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0445  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0452  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.654019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0506  preprotein translocase subunit YajC  42.34 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  37.61 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  41.96 
 
 		 116 aa  87.8  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  36.11 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  38.39 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  45.24 
 
 		 109 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 		 108 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  41.07 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  35.19 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  35.19 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  46.3 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  34.91 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  34.91 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  41.67 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  36.11 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  37.84 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  44.05 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  36.04 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  40.48 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2351  preprotein translocase subunit, YajC  41.51 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  41.67 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>