297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5120 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 92 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  80 
 
 		 94 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  78.02 
 
 		 91 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  76.4 
 
 		 108 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  78.02 
 
 		 91 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  75.82 
 
 		 109 aa  140  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  75.82 
 
 		 110 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  74.44 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  70.33 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  69.66 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  67.82 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  63.33 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  65.52 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  65.52 
 
 		 110 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  63.22 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 108 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  62.07 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  62.22 
 
 		 107 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  60 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  60 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  68.13 
 
 		 91 aa  120  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  62.35 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  58.62 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  57.14 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  55.29 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  51.72 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  55.95 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  50.59 
 
 		 109 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  53.49 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  51.76 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  51.76 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  50.59 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  60 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  48.31 
 
 		 111 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  47.62 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  45.12 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  53.25 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  48.19 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  48.19 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  48.31 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  49.38 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  45.05 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  47.56 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  46.91 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  51.9 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  51.25 
 
 		 107 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  48.78 
 
 		 103 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1179  preprotein translocase subunit, YajC  46.84 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  45.98 
 
 		 93 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  44.05 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1276  protein translocase subunit yajC  44.44 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000142603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  45.45 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  46.05 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  46.05 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1109  preprotein translocase, YajC subunit  43.33 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0033679  normal  0.183773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 		 94 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4620  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  49.33 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  45 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40470  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  41.57 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  43.75 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  43.68 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  54.05 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  41.24 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1414  preprotein translocase, YajC subunit  44.44 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1229  preprotein translocase subunit YajC  44.44 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0682  preprotein translocase YajC subunit  40.7 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1240  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.659198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>